MEGA：系统树（进化树）的构建

MEGA：系统树（进化树）的构建

主要用于进化分析获得的序列信息。通过它可以编辑序列的数据、进行序列的比对、构建系统发育树和推测对比物种序列间的关联程度及进化距离等。

首先在NCBI等文献搜索软件中搜索目的序列，此处以端粒telomere为例，打开其中一个搜索结果

点击右边的Run BLAST进行比对

注意，如果此处输入的是序列，右边的序驾驾劫列比对范围无法设定，如果是编号可以设置，这里我设置的是从1到200个核酸比对

比对的结果及其详细信息就是下面这样（三幅图是连在一起的）。这里我选择了前十个对比序列

在Donwload下设置下载的文本格式，点击Continue进行下载，设置好储存路径。保存好以后将文本打开，格式设置为自动换行

打开MEGA，创建比对框。根据自己的需要选择选项，点击OK。如果需要比对的是核酸，点击DNA，如果是蛋白质点击Protein

点击比对框中肺注Edit菜单下的Insert Sequence From File；选择自己之前下载的序列格式，因为我刚才的是Text文本格式，所以这里我选择Text（注意：如果格式不正确，则之前保存的序列不会出现）。选好格式后，自己的核酸序列文本显示出来，点击后打开

打开后MEGA进行序列比对分析，根据比对结果可通过Edit对序列进行编辑

分析好后点击Date菜单下的Phylogentic Analysis进行构象树分析

然后在主菜单上点击Analysis点击Phylogeny，在选择第二个选项并确定。点击Compute进行比对构建构象酱狠树

下面是比对的结果