菌种鉴定——ANI
的有关信息介绍如下:二代测序及科学研究的快速发展,菌种鉴定也由DNA-DNA-杂交的生化实验专项基于核酸序列的两两比对。相比镜检、生化实验和传统药敏和血清型试验,基于全基因组测序的菌种鉴定也迎来了更方便的手段,同时,也使得菌种鉴定结果更为准确精细。
待测菌株的DNA提取,手工提取或者试剂盒提取皆可。
DNA浓度≥100ng/ul
DNA总量≥1.5ug
OD260/280:1.8-2.0
测序文库构建上机测序。
或者将核酸送测序公司测序。
测序深度不小于30倍
测序数据用MicrobeTrakr plus直接分析得到鉴定结果。
或者测序数据拼接,拼接好使用MicrobeTrakr直接分析得到鉴定结果。